投资和费用是实验室废水处理工程设计和日常维护管理需要考虑的主要因素。在满足环保、卫生、安全要求的同时,应尽量减少废水处理工程的建设投资及运行费用,降低能耗,提高效率。影响投资费用的因素有：
    一、废水处理工艺和处理级别
    不言而喻,采用一级处理液氯消毒工艺要比采用二级处理液氯消毒工艺便宜的多,采用自排式流程要比采用提升式的运行费用低。所以实验室废水若直接排入城市下水道,一般只选用一级处理的流程。若排入地面水环境质量标准规定的Ⅲ类水域,则需要采用二级生化处理或更高级的处理流程,投资费用相对要增加很多。
    二、处理站的规模
    处理站的规模越大,处理水量越多,总的投资费用也就越高。因此节约用水,减少实验室废水的水量对节省投资和费用具有十分重要的意义。通过采用清污分流的办法,将受到致病菌污染的含菌废水同其他废水分开,只对含菌废水进行消毒处理。这样就可以缩小实验室废水处理站的规模,节省投资费用。
    另外从处理每立方米废水的单位投资和费用来分析,则是处理站规模越大,相应的单位处理水量的投资和费用就愈低。而处理水量越少,则相应的单位投资费用就高。
    三、实验室的类别与水质
    实验室类别与废水的水质对处理工艺的选择与工程造价费用也有影响。含有较多的消毒剂等化学物质,所以要求较高级的处理,较高的余氯量和较长的接触时间,管理要求也比一般的实验室严格,所以投资费用也较高。
    四、消毒剂的种类
    采用不同的消毒剂消毒实验室废水其工程造价、设备费用和运行费用是很不相同的。液氯作为一种常用的消毒剂用于实验室废水消毒无论是在设备费用上和所需的土建工程投资上相对次氯酸钠发生器、臭氧发生器等都低的,由于其价格便宜、操作简单,经常的维护运行费用也低的。
    五、地区的差别
    我国地域辽阔,南方北方气候条件不同,施工费用、材料费用也有很大差别,南方地区没有供暖、冰冻问题,下水道埋设较浅,施工费用一般比北方要便宜。其他像城区、郊区,水文地质条件等等均对处理站的造价有不同程度的影响。
    六、设备选型
    实验室废水处理设备选择直接影响工程费用及运行费用,如加氯机采用进口的,每台售价近万元,而国产化加氯机售价仅为进口的二分之一,主要性能还优于进口机。水泵、次氯酸钠发生器、臭氧发生器也有多种型号产品,价格、质量差别很大,必须注意选择。